Bei der Follikelpunktion werden die Eizellen aus dem Körper gewonnen. Unter Ultraschallsicht wird dabei mit einer dünnen Hohlnadel durch die Scheidenwand punktiert und die Spitze der Nadel bis in die Mitte des ersten Follikels weitergeführt. Jetzt wird mit einem sanften Unterdruck der erste Follikel abgesaugt. Mit der Flüssigkeit die dabei in ein Röhrchen kommt, soll auch die Eizelle aus dem Follikel gespült werden. Danach werden alle Follikel von beiden Seiten auf diese Weise entleert. Die Punktion dauert durchschnittlich 3 bis 5 Minuten. Die Punktion kann ohne Schmerzausschaltung, in einer sogenannten „Sedierungsanalgesie“ (Dämmerschlaf) oder in einer Kurznarkose erfolgen.